Gerei a GFIP e meu autônomo não foi levado o que verificar?
Os autônomos ficam cadastrados no sistema Departamento Pessoal e lá eles possuem dois cadastros, um vinculado na empresa e outro que é o cadastro padrão, para verificar porque ele não foi levado deve ser verificado o tipo da categoria do mesmo
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Acesse o Departamento Pessoal - aba Contribuinte - Autônomo e selecione o autônomo e na aba Dados complementares, verifique a Categoria do mesmo
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Agora acesse Departamento Pessoal - aba Contribuinte - Vinculo empresarial selecione a empresa e o autônomo e na aba dados complementares, verifique a categoria do mesmo
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Verifique se as categorias batem e se precisa ser ajustado, caso faça algum ajuste, basta gravar e gerar o arquivo da GFIP novamente.
Algumas categorias possuem contribuição, outras não possuem, verificar qual é a correta para seu autônomo. 
