Orientar quanto a solução da mensagem: "A versão que você está usando (SISTEMA XXX) é inferior a versão que foi usada anteriormente (SISTEMA YYY), mudanças na estrutura da base de dados podem comprometer o funcionamento do sistema. Atualize sua versão."
No geral essa mensagem ocorre quando o instalador da nova versão não foi devidamente sincronizado com a máquina, desta forma, para sincronizar o instalador:
Para saber como realizar esta atualização utilizando o Alterdata Installer, clique aqui.