Entendendo a configuração
Possuímos no sistema a opção Não processar a 1ª parcela para os funcionários com adiantamentos pagos em férias ou em folha para que funcionários que já tiveram o adiantamento da 1º parcela paga em outro processo, como férias ou folha, NÃO calcule a parcela novamente.
Para isso siga as orientações abaixo 
Como configurar
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Acesse o WDP - Menu
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Acesse a aba Décimo Terceiro e marque a opção Não processar a 1ª parcela para os funcionários com adiantamentos pagos em férias ou em folha?;
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Em seguida, clique em Gravar.
Para que seja identificado pelo sistema que o valor da 1ª parcela do Décimo Terceiro já foi pago ao funcionário, o adiantamento realizado em férias ou em folha de pagamento deverá ser efetuado utilizando o evento 003 – Primeira Parcela Décimo Terceiro Salário. Saiba mais sobre como processar o adiantamento em férias clique aqui.
Caso o adiantamento da 1ª parcela seja pago utilizando outro evento o valor não será considerado e o sistema calculará a 1ª parcela para o funcionário.