Foi criado para a versão 6.1349 o recurso para configurar o certificado na base de dados para NFeasy Dll para não ser necessário instalar o certificado por usuário que o cliente utiliza.
Configuração a ser realizada na 6.1349
1- O arquivo do certificado precisa estar instalado como exportável
2- E precisa configurar novamente o certificado em movimento de estoque > Configurar NF-e > aba Opções por empresa, saberá que configurou na base quando aparecer a mensagem Certificado armazenado na base de dados.