Essa rejeição ocorre quando a nota que foi Enviada para a Sefaz, veio de um outro sistema ou seja, foi importada para o Emissor através do txt ou Xml.
Então ao Enviar para a Sefaz a nota, no Xml as tags cNF e nNF ficam com o mesmo número conforme estão no txt exportado pelo outro sistema e ocorre a rejeição.
Como Resolver?
1- Será necessário selecionar a nota rejeitada e clicar em 
2- o sistema irá criar uma nova nota com os mesmos dados da anterior porém com nova numeração, então é só clicar em 