Essa rejeição ocorre quando foi informado o motivo da desoneração do ICMS e o valor do ICMS desonerado não foi informado ou então foi informado o valor 0,00.
OBS: CST's que habilitam os campos de Motivo da Desoneração do ICMS e valor do ICMS desonerado, 20- 30- 40- 41- 50
Para NÃO destacar o ICMS desonerado:
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Clique em Detalhar a nota.
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Na Aba produtos e serviços, clique em editar o produto.
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Na Aba Tributos -> ICMS
O Campo 
Se tiver com o valor 0,00 a nota será rejeitada.
Para destacar o ICMS desonerado na NF-e, esses campos precisam estar preenchidos. Lembrando que eles só habilitam de acordo com o CST (código situação tributária) informado.