Quando ocorre o erro
Essa mensagem de erro na validação pode ocorrer no retorno do evento S-2299 - (Desligamento) quando a informação do número de PIS do Funcionário está em branco ou inválido em seu cadastro. Sendo necessário ajustar essa informação e reenviar o evento S-2299.
Lembrando que retificações são diferentes de alterações cadastrais:
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Caso o PIS informado no evento S-2200 estava correto e foi alterado para o PIS informado no evento S-2299, basta enviar um evento de alteração cadastral (S-2205).
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Caso realmente este estava incorreto desde o início, será necessário retificar o evento S-2200.
Mas fique tranquilo, ao ajustar o PIS no cadastro deste funcionário o sistema faz essa verificação a partir da data de alteração que você informar e envia automaticamente o evento correto para você! 
Como efetuar o ajuste
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Acesse a aba Funcionário - ícone Cadastro de Funcionários e selecione a empresa e funcionário;
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Após acesse a aba Documentos - sub-aba Básicos e preencha o campo PIS/PASEP, após informe a data correta de alteração e grave;
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Com isso, acesse a Central eSocial - Andamento dos envios e aguarde até que o evento de alteração (S-2205) ou retificação (S-2200) seja processado;
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Depois, selecione o evento S-2299 com o erro e clique em Detalhes - Reprocessar;
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Na aba Central eSocial será apresentado um novo evento S-2299 que será reenviado.